Trận thứ nhất (Bảng B): Liên quân 3 (Trung tâm Ứng dụng Công nghệ thông tin, Viện Nghiên cứu Đông Nam Á, Bảo tàng Dân tộc học Việt Nam, Nhà xuất bản Khoa học xã hội) gặp Liên quân 9. Tỉ số trận đấu 1-0. Bàn thắng duy nhất do Tuấn Anh (Liên quân 3) ghi ở phút 45.
LQ9 có 1 điểm trong tay, họ chỉ cần không thua trận này là qua vòng loại, vì đối thủ LQ3 chưa được điểm nào. Nếu chỉ căn cứ vào các dữ kiện trước giải thì LQ9 được đánh giá cao hơn. Vì vậy, khán giả hi vọng đội này sẽ vùng lên và đá đúng thực lực của họ.
Ngay phút thứ 3, từ đường chuyền của Minh Tuấn, Lâm Anh (LQ9) sút rất căng và bóng lần lượt đập má trong hai cột dọc rồi bay ra ngoài trong sự tiếc nuối của khán giả. Ngay lập tức LQ3 trả miếng bằng một cú sút chệch cột. Phía bên LQ9, các miếng phối hợp giữa Minh Tuấn - Anh Đức - Ngọc Trí khá nhuần nhuyễn nhưng LQ3 có thể lực trội hơn, phòng ngự rất chặt. LQ9 tấn công nhiều nhưng thiếu hiệu quả. Duy Cương (LQ3) là cầu thủ đá bao sân, xông xáo và nhiều đợt tấn công được phát động từ anh là khá nguy hiểm. Hiệp 1 kết thúc với tỉ số hòa 0-0.
Sang hiệp 2, LQ9 củng cố lực lượng, hi vọng ghi bàn cho chắc ăn. Nhưng họ đã bỏ lỡ mấy cơ hội. Phút 45, trong một pha dàn xếp đơn giản, bóng treo trước khung thành và Tuấn Anh (LQ3) đã đội đầu gọn ghẽ: 1-0. LQ9 dù đã hết sức cố gắng nhưng so với trận trước (23-9) họ đá cũng không hơn là bao. Tỉ số 1-0 đã phản ánh đúng cục diện trận đấu.
Trận thứ hai (Bảng A): Liên quân 7 (Viện Nhà nước & Pháp luật, Viện Nghiên cứu Văn hóa, Viện Nghiên cứu Tôn giáo) gặp Liên quân 6 (Viện Nghiên cứu Trung Quốc, Viện Nghiên cứu Con người, Viện Triết học). Tỉ số trận đấu 4-0. LQ7 đã có một trận đấu tưng bừng, đè bẹp LQ6. Các bàn thắng của LQ7: Anh Tuấn (2 bàn), Hoàng Hải (1), Trần Hoài (1). LQ7 đã đứng đầu với 7 điểm.
Trận thứ ba (Bảng A): Liên quân 2 (Viện Từ điển học & Bách khoa thư Việt Nam, Viện Ngôn ngữ học, Viện Văn học) gặp Viện Sử học. Tỉ số trận đấu 1-1, bàn thắng do Văn Bảo (Viện Sử học, phút 4), Việt Dũng (LQ2, phút 46). Tình thế hai đội giống hệt bảng B (LQ3-LQ9 vừa đá ở trận 1 xong). Ngay phút thứ 4, từ một pha lừa bóng không thành, Việt Dũng để mất bóng vào chân Văn Bảo và tiền đạo này đã không cho Trường Sinh cơ hội cản phá bằng một cú sút cận thành thẳng như kẻ chỉ: 1-0. Bàn thua làm cho LQ2 có phần bị khớp về tâm lí. Nhưng họ nhanh chóng ổn định đội hình và mở rất nhiều đợt tấn công hãm thành. LQ2 liên tục có các quả phạt góc và biên. Tuy nhiên, Đội Sử học thực hiện chiến thuật “catenacio-đổ bê tông” rất chặt, vì vậy LQ2 tấn công nhiều nhưng hoàn toàn bế tắc. Phút 46, từ một pha đá phạt, Việt Dũng đón được bóng và sút như trái phá, quân bình tỉ số 1-1. Từ đây, LQ2 mở nhiều đợt vây hãm khung thành đội Sử học và nếu không có thủ môn Danh Huấn (chơi đặc biệt xuất sắc) bằng các pha cứu nguy xuất thần thì chắc chắn tỉ số không dừng lại ở đây. Phút 52, Thanh Tâm đánh đầu hụt và phút 58 Hưng sút một cú sạt xà ngang, chấm dứt hi vọng lội ngược dòng của LQ2.
Trận thứ tư (Bảng C): Liên quân 1 (Văn phòng và các Ban chức năng) gặp Liên quân 4 (Viện NC Châu Âu, Viện Địa lí nhân văn, Viện Dân tộc học, Viện NC Ấn Độ và Tây Nam Á). Tỉ số trận đấu 4-1. Các bàn thắng, LQ1: Văn Dưỡng (1), Sĩ Tiếp (1), Hà Bình (1). LQ4: Văn Tùng (1), Đức Trung (1, phản lưới nhà).
Như vậy, 4 trận ngày 27 tháng 9 đã khép lại vòng loại. 8 đội: LQ1 (Văn phòng và các Ban chức năng), LQ3 (Trung tâm Ứng dụng Công nghệ thông tin, Viện Nghiên cứu Đông Nam Á, Bảo tàng Dân tộc học Việt Nam, Nhà xuất bản Khoa học xã hội), LQ4 (Viện NC Châu Âu, Viện Địa lí nhân văn, Viện Dân tộc học, Viện NC Ấn Độ và Tây Nam Á), LQ6 (Viện Nghiên cứu Trung Quốc, Viện Nghiên cứu Con người, Viện Triết học), LQ7 (Viện Nhà nước & Pháp luật, Viện Nghiên cứu Văn hóa, Viện Nghiên cứu Tôn giáo), LQ8 (Viện Khảo cổ học, Trung tâm Nghiên cứu Kinh thành), Viện Sử học, Viện Thông tin KHXH vào tứ kết. LQ2, LQ5, LQ9 ngậm ngùi nói lời chia tay. Họ đành chờ 2 năm nữa để trở lại sân chơi này.
Lượt thi đấu tứ kết sẽ diễn ra vào ngày 01/10/2013./.
Phạm Văn Tình & Nguyễn Thu Hà